El Laboratorio de Secuenciación de ADN abrió sus puertas en 2004 con la misión de apoyar al personal académico del INECOL en la obtención de datos moleculares para el desarrollo y aplicación de la investigación científica que se realiza en el Instituto. Esto se enmarca en su compromiso institucional de generar, transferir y difundir el conocimiento científico en torno a la ecología y la diversidad biológica en beneficio de la sociedad.

Con este fin, el Laboratorio ha modernizado su infraestructura con la incorporación de un Secuenciador SeqStudio de 4 capilares, equipo de última generación que, respaldado por un equipo humano altamente capacitado, permite llevar a cabo la secuenciación de ADN con mayor eficacia mediante electroforesis capilar.

La secuenciación Sanger es la tecnología estándar por su alta precisión, capacidad de lecturas largas y flexibilidad para una amplia gama de aplicaciones. El análisis de fragmentos de ADN, por su parte, habilita desde genotipificación e identificación de especies hasta tamizaje de organismos y perfiles de expresión génica. Entre las aplicaciones que pueden realizarse en el equipo destacan:

• Identificación y descripción de especies

• Establecimiento de relaciones filogenéticas entre especies

• Identificación de patrones de distribución de variación genética dentro y entre poblaciones

• Análisis de procesos ecológicos y evolutivos en poblaciones silvestres

• Secuenciación Sanger de novo, dirigida y de plásmidos

• Genotipificación de polimorfismos de un solo nucleótido (SNP)

• Confirmación de secuenciación de nueva generación (NGS)

• Confirmación de edición genómica por CRISPR-Cas9

• Análisis de inestabilidad de microsatélites (MSI)

• Detección y análisis de variantes somáticas de bajo nivel