Generar conocimiento científico de frontera enfocado a la solución de problemas de relevancia regional, nacional e internacional para optimizar el manejo sustentable de los recursos naturales. Crear una red internacional de investigación transdisciplinaria de vanguardia, que permita generar sinergias y hacerle frente a los grandes retos ambientales y agropecuarios actuales.

• Química orgánica
• Química de productos naturales
• Nano-química computacional
• Agro-nanotecnología y nanotecnología ambiental
• Diversidad de insectos
• Diversidad microbiana
• Genómica y transcriptómica
• Proteómica
• Microscopía avanzada
• Interacción planta-microorganismo
• Biología de desarrollo de plantas
• Biogeografía
• Ecología química
• Farmacología Experimental

Conformar un equipo multidisciplinario para llevar a cabo investigación de vanguardia con impacto internacional, que contribuya a la solución de problemas reales para la sociedad. Así mismo, fungir como un nodo central de colaboración de una amplia red de desarrollo científico y tecnológico, enriqueciendo y fortaleciendo a la comunidad del INECOL a través de la formación de recursos humanos de alto nivel.